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VIRA-PORE COVID類似病毒空氣采樣技術驗證摘要

VIRA-PORE空氣病毒采樣盒

空氣采樣盒,用於(yu) 收集病毒顆粒

具有ZePore™過濾器的Vira-Pore病毒采樣盒經過專(zhuan) 門設計和驗證,可用於(yu) 收集空氣傳(chuan) 播中的冠狀病毒,並且它可用於(yu) 采樣其他類似的病毒。

目標

為(wei) 了確定冠狀病毒空氣采樣的合適參數,本驗證采用直徑37mm孔徑1 µmPTFE層壓ZePore空氣病毒過濾器對冠狀病毒的替代物--人類冠狀病毒OC43HCoV OC43)進行空氣采樣。 人冠狀病毒OC43和COVID病毒均為(wei) 正向單鏈RNA+ ssRNAβ包裹的冠狀病毒,因此OC43是合適的COVID病毒模擬物。 通常以往在過濾器上進行病毒采樣的研究沒有包括基本的驗證數據,例如確定從(cong) 過濾器上洗脫病毒的合適技術,在采樣過程中或在運輸及存儲(chu) 過程中病毒在過濾器上的穩定性等數據。

 

方法

標準化病毒空氣采樣的持續時間,提取洗脫的病毒RNA,然後用超微量核酸蛋白分析儀(yi) 進行RNA定量(ng / µL為(wei) 單位),采用熒光定量PCR儀(yi) 對現場樣品進行測試,所有實驗均重複三次(除非另有說明)。實驗結果采用病毒相對回收質量(relative recovery)來表示。病毒相對回收質量(RRmass)是從(cong) 過濾器洗脫的病毒質量濃度(ng / ml)相對於(yu) 初始霧化器懸浮液中病毒質量濃度(ng / ml)的比率。過濾器安裝在開口式37mm三層導電聚丙烯盒中。導電盒優(you) 選用於(yu) 空氣微粒采樣,以防止靜電吸附到盒壁。空氣流量初步設置為(wei) 10 L / min,方便在短時間內(nei) 較大程度地收集病毒。帶有過濾器和支撐墊的壓降為(wei) 17英寸水壓,與(yu) 某些個(ge) 人采樣泵(例如Gilian 12GSA SG10SG10-2)兼容。空氣樣品以10 L / min的流量進行病毒顆粒空氣采樣10分鍾,同時另一個(ge) 樣品采用對過濾器加標病毒顆粒懸浮液,兩(liang) 個(ge) 樣品均使用兩(liang) 種不同的方法對病毒RNA進行洗脫。兩(liang) 種情況下回收率均較高的洗脫方法都是將濾膜向內(nei) 卷起來,然後將其放入裝有1 mL MTM培養(yang) 基(Longhorn Vaccines and Diagnostics™Inc。)的2 mL微量離心管中,並渦旋三次,每次渦旋10秒。霧化病毒懸浮液是使用Collison霧化器在II級生物安全櫃中產(chan) 生的。此過程產(chan) 生的平均空氣傳(chuan) 播顆粒濃度為(wei) ~1 x 10^8/ L。進行空氣采樣,采樣10分鍾,60分鍾後,立即將濾膜中的病毒洗脫下來, 或采樣10分鍾將其暴露在清潔的氣流中60分鍾再洗脫病毒。 

結果

對於(yu) 采樣10分鍾的樣品,RNA質量濃度和RRmass(圖1中的紫色條)分別為(wei) 2.0 x 10^6 ng / mL±1.06 x 10^6)和0.55±0.18)。對於(yu) 采樣60分鍾的樣品,平均RNA質量濃度為(wei) 5.98 x 10^6 ng / mL±1.79 x 10^6),調整采樣時間後的RRmass(圖1中的藍色條)為(wei) 0.32±0.10)。在采樣10分鍾的樣品中,然後將其暴露在清潔的氣流中60分鍾,RNA質量濃度和RRmass(圖1中的橙色條)分別為(wei) 2.17 x 10^6 ng / mL±6.97 x 105)和0.50±0.16)。這些結果表明,在分別采樣10分鍾,60分鍾和10分鍾,然後暴露於(yu) 清潔氣流60分鍾後,霧化病毒的回收率是相似的,差異無統計學意義(yi) (p = 0.31)。在另一個(ge) 實驗中,空氣樣本分別在4°C25°C下存儲(chu) 7天。在4°C下,RNA質量濃度為(wei) 4.41 x 106 ng / mL±2.51 x 10^6),在25°C下存儲(chu) 時為(wei) 1.34 x 10^6 ng / mL±8.23 x 105)。因此,房間存放條件下的平均濃度比冰箱存放條件下的平均濃度低3.3倍。由於(yu) 實驗的可變性,差異沒有顯著差異(p = 0.11)。如圖1所示,4°C存儲(chu) (綠色條)和25°C存儲(chu) (黃色條)的RRmass分別為(wei) 0.55±0.31)和0.17±0.10)。通過qRT-PCR進一步分析了上述每組實驗中的一個(ge) 洗脫樣品,以顯示總RNA分析方法未產(chan) 生誤導性結果。 對於(yu) 這兩(liang) 個(ge) 樣品,檢測到的RNA濃度相似:每毫升4.01 x 10^6 RNA拷貝(用於(yu) 4°C儲(chu) 存)和每毫升4.18 x 10^6 RNA拷貝(用於(yu) 25°C儲(chu) 存)。對於(yu) 這兩(liang) 個(ge) 樣品,qRT-PCRCT值均高於(yu) 30,是接近檢測下限的Ct值。 這可以解釋兩(liang) 個(ge) 微量樣品之間值的相似性,以及為(wei) 什麽(me) 與(yu) 總RNA分析不同,兩(liang) 個(ge) 樣品之間的差異不明顯。 在進行進一步工作之前,建議在分析之前將樣品冷藏保存。

 

結論

•COVID病毒的替代物人類冠狀病毒OC43HCoV OC43)被成功霧化,收集並回收用於(yu) 分析。

與(yu) 搖床方法相比,渦旋洗脫產(chan) 生更高的RNA濃度。

在三種不同的采樣場景(10分鍾,60分鍾和10分鍾後暴露於(yu) 60分鍾的清潔氣流)後,從(cong) 過濾器中回收霧化病毒的差異沒有顯著差異。

比較在4°C25°C儲(chu) 存後病毒的回收率,與(yu) 在25°C儲(chu) 存後相比,病毒在4°C儲(chu) 存後的回收率高約3倍; 但是,由於(yu) 實驗的可變性,差異沒有統計學意義(yi) 。

 

注意:VIRA-PORE病毒采樣盒已經過測試可從(cong) COVID替代病毒中回收RNA病毒,但尚未測試過從(cong) COVID病毒中收集RNA病毒。 請參閱技術摘要說明的測試方法和測試結果。 客戶應自己負責遵守(i)產(chan) 品使用說明和(ii)收集空氣傳(chuan) 播的病毒後,與(yu) 產(chan) 品的使用和安全處理以及包裝,標簽和運輸有關(guan) 的所有適用的政府法律,規則,法規和行業(ye) 標準。生產(chan) 商建議您在進行任何空氣采樣之前,先向具有病毒專(zhuan) 業(ye) 知識的合格環境微生物實驗室尋求指導。 尋求指導,安全的處理和運輸程序,因為(wei) COVID病毒是高度傳(chuan) 染性的病原體(ti) ,如果暴露則具有重大健康隱患。

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