一項由美國聖裘德兒(er) 童研究醫院（St. Jude Children's Research Hospital）與(yu) 美國病原微生物宏基因組測序領域代表企業(ye) Karius合作發表於(yu) JAMA Oncology期刊的臨(lin) 床研究表明，基於(yu) NGS技術的新型血液檢測方法能夠在高風險臨(lin) 床症狀出現前，對小兒(er) 複發或難治性白血病患者的血流感染（BSI）進行檢測，進而使得相應的預防性治療成為(wei) 可能。

感染是白血病患者死亡的主要原因。在*，接受化療的癌症患者（例如白血病）往往麵臨(lin) 著致命的高感染風險。一些白血病患兒(er) 死於(yu) 感染的幾率甚至要高於(yu) 死於(yu) 癌症本身的幾率。目前，廣譜抗菌藥物被用於(yu) 防止感染發生的預防性治療，或在感染症狀或體(ti) 征出現時被用於(yu) 經驗性抗菌治療，但這種方法隻有約一半的成功率，且會(hui) 導致抗生素耐藥性。測序技術的發展使得基於(yu) 血液的非侵入性感染預測篩查方法有望在症狀出現之前幫助臨(lin) 床開展靶向抗菌治療，並可能改善臨(lin) 床結果。

據悉，JAMA Oncology新文章中使用的檢測方法由Karius公司開發，名為(wei) “Karius Test”。作為(wei) 一種基於(yu) 微生物cfDNA的非侵入性血液檢測方法，Karius Test使用NGS技術，僅(jin) 需單次抽血就能利用遊離在血液中的微生物病原體(ti) DNA的片段，快速檢測（約1個(ge) 工作日）1400多種細菌、DNA病毒、真菌以及寄生蟲，大大彌補了傳(chuan) 統感染檢測耗時久、可檢出病原體(ti) 數目少的缺陷。

在本項研究中，47名參與(yu) 研究的複發性或難治性白血病兒(er) 童（平均年齡為(wei) 10歲）中，12名患者共計發生了19例血流感染，其中16例感染具有可供預測分析的診斷樣本。研究人員評估了Karius Test在檢測血流感染的敏感性和特異性。研究結果顯示，Karius Test能夠早在患者出現症狀的三天之前，發現75%（12/16）的血流感染。以15例細菌感染來計，預測敏感性為(wei) 80%。同時，總體(ti) 的診斷敏感性為(wei) 83%，細菌感染為(wei) 88%。研究人員還檢測了33個(ge) 陰性對照樣本，27個(ge) 樣本中未檢測到細菌或真菌，特異性為(wei) 82%，且33個(ge) 樣本有30個(ge) 未發現常見的血液病原體(ti) ，特異性為(wei) 91%。研究人員介紹，這項新研究提供了首份證據，證明Karius Test可以用於(yu) 感染預測。

“一個(ge) 重要信號表明，即使在臨(lin) 床症狀出現之前，我們(men) 就有望預測這類易感人群的感染。”Karius公司高級醫學總監Asim Ahmed表示。但由於(yu) 假陽性率較高，其報告的82%特異性使得這種方法還無法適用於(yu) 篩查。“Karius Test目前還無法作為(wei) 一種篩查方法使用，我們(men) 需要進一步開展研究以指導如何將該檢測整合到臨(lin) 床工作流程，以幫助預測和預防免疫功能低下患者的感染。”

該公司表示，未來這項研究將繼續擴展，以進一步分析Karius Test在臨(lin) 床症狀出現前識別血流感染的能力。研究團隊也相信，隨著技術的進步，微生物cfDNA測序終可用來指導癌症患者的早期治療。

 這其中，快速精準以及低微核酸起始量（10pg-100ng）的測序文庫構建，得益於(yu) Nugen公司的Ovation Ultralow Library System V2 超微量文庫構建技術，該技術廣泛適用於(yu) 各種類型的核酸樣本建庫，尤其在麵對cfDNA檢測的超低起始量時表現良好，並能在3小時內(nei) 完成簡單，自動化的建庫過程，並能應對各種GC含量的高保真擴增。技術路線如下：

參考資料：

1. Evaluation of Plasma Microbial Cell-Free DNA Sequencing to Predict Bloodstream Infection in Pediatric Patients With Relapsed or Refractory Cancer

2. Karius Test Demonstrates Ability To Detect Bloodstream Infections In Pediatric Patients With Cancer Before Symptoms Develop

3. Blood-Based Sequencing Test Identifies Pediatric Cancer Infections Before Symptoms